苻登虽然常打胜仗却也捞不着太多的便宜。公元389年，苻登又攻克后秦的平凉，向姚苌大军所在的安定逼近。姚苌身边的大将都劝皇帝与前秦决战，姚苌却不以为然，他认为苻登的这支军队已经远征多时，正求奋力杀敌以早日回家，因此不宜决斗，应该用妙计取胜。于是，他令尚书令姚旻留守，自己则亲率三万大军偷袭秦军的辎车行李，大获胜利，并俘虏了苻登的皇后毛氏和两个王子以及数十名战将。对此失败，苻登大为恼火，却又无可奈何。
公元392年，姚苌再次领兵前去迎战苻登，行到新支堡却病倒了，并梦见苻坚带领天官使者和几百鬼卒冲入营栅，宫人出于迷信抛出长矛为他驱除所谓鬼卒，却误中他的阴部，病势由此转重。姚苌急忙召太尉姚旻，尚书左仆射尹纬、右仆射姚晃等接受顾命，又叮嘱姚兴说：“这几位大臣都是我的患难之交，你切不可轻信别人对他们的诬陷。对骨肉要亲爱，对大臣要礼待，凡事要讲信用，对百姓要施恩，做到这四样，国家就能长治久安，我死也瞑目了。”几天后，姚苌病逝，时年64岁，葬于原陵，谥“武昭皇帝”，庙号“太祖”。
