这一时期，伤寒论的研究远远突破了对张仲景原文的校订、训诂及对个别疑难条文的阐释，而进入到基本理论问题的开创性拓展阶段，由此而取得的一系列突破，充分显示出现代中医学的进步。
对伤寒病名的含义，各家对照中西学说，提出了许多深刻的见解；对西医感染性疾病的理论核心——细菌学说，一半以上的论著都给予了详细的阐述；另外，在伤寒转变、六经含义、六经提纲及一些重要条文的解释上，也均取得了较大的突破。[14]
在西方医学东传方面，以丁福保最为引入注目。他一生致力于翻译医书、出版杂志、组织医会、创办医院、疗养院，著述丰硕，被誉为是一代学术名家。
1900年，丁福保编印了第一本通俗的西医常识书《卫生学问答》。1914年，他将由日文译成的68种医学著作编成《丁氏医学丛书》，第一次比较全面地向国人介绍了现代西方医学知识，一举获得柏林及罗马的万国博览会最优等奖。
自民国初年至20世纪30年代早期，丁福保的一项主要工作是编辑《中西医学报》，历时20年，迅速而又大量地把现代医学知识介绍给国人，适应了当时中国医学界渴望新学的需要，对促进中医界了解西医做出了重大贡献。据统计，他这一段时间的译作超过了自1851年合信起的所有教会译著的西医著作之总和，此后很长时间，也没有人在介绍和普及西方医学方面能与他相提并论。在传播西医的同时，丁福保还极力主张中医科学化。“中医科学化”这一口号最早便是出自于他。因此，在民国医学史上，丁福保的地位不容忽视。