基督教（新教）传入中国的时间虽然晚于天主教，但其在华发展的速度并不比天主教逊色。到1906年止，经过英、美等国新教传教士的努力，共在中国建立教会82个，派遣传教士3832人，发展教徒共178251名。[8]从总体上看，天主教影响的对象主要是以农民为主体的社会下层，而基督教的多数差会和传教士则热衷于办报、办学、译书等文化事业，在士大夫阶层及知识分子中有较大的影响。因此，尽管基督教拥有的信徒比天主教少，但它在当时中国社会中的影响却不可低估。
晚清时期，东正教的传播状况虽然落后于天主教和基督教，但仍然呈现出迅速发展的势头。由于种种历史原因，东正教在华的发展一度处于迟滞状态。在1860年以前的百余年间，含雅克萨俘虏的后裔在内，北京的东正教徒不过200人，加上北京以外的哈尔滨、张家口、天津、汉口等地的少数教徒，总数亦仅300多人。这种情况直到1878年始发生变化。是年，修士大司祭弗拉维昂·高连茨基率领第16届传道团来华。鉴于东正教在华发展缓慢，弗拉维昂·高连茨基改变传道团主要参与俄国外交活动的方针，开始重视传教事务。其教会及传教士在北京、内蒙、汉口等地积极开展传教活动，使这一教派得到迅速发展。到1902年，我国境内建成的东正教教堂已有32所，信徒总数达5587人，仅北京就有教徒上千人，[9]是40年前的5倍。