孙中山委派伍廷芳，与袁世凯的代表唐绍仪进行谈判。伍廷芳代表孙中山重申：只要清帝退位，宣布实行共和制，袁世凯就可以就任总统。
袁世凯看透了革命派对共和制的迫切心理，就唆使北洋军阀姜桂题等四十七人联名通电反对共和，主张君主立宪制，并威胁说他要召回北方议和代表，以逼迫革命派做出让步。
袁世凯反对共和制，当然是一直为共和制而努力的孙中山所不能答应的，他决定用武力来回答袁世凯的无理要求。1 月11 日，孙中山宣布自任总指挥，兵分六路北伐那些嚣张跋扈的军阀。
北伐军多处旗开得胜。但是，刚刚产生的南京临时政府财政困难，不能应付北伐的军需，军事力量也很薄弱。这时，钻进革命阵营内部的旧官僚政客、立宪党人，大力鼓吹“议和”和“南北统一”。
袁世凯除了在军事上继续抵抗北伐军，又政治上玩弄阴谋，打算把北京的清政府、南京的临时国民政府一同取消，由他在天津另外组织一个临时政府以“统一”全国。
孙中山坚决反对袁世凯的狼子野心，在报上发表文章斥责他是“民国之蠹”。但是，孙中山反对袁世凯的斗争，在同盟会内得不到支持，连他最好的助手——临时政府的陆军总长黄兴——也写信给胡汉民、汪精卫抱怨说：如果军费不能解决，议和搞不成，他就难以指挥军队，只有切腹自杀了。
