5月31日袁世凯准黄兴辞南京留守职，南京留守机关准即取消。黄兴于6月14日宣告解职。
本月中国佛教总会第一次全国代表大会召开。
刘师复在广州组织无政府主义团体晦鸣学社。
6月9日孙中山在广州与各界探讨平均地权与地价抽税问题。
6月15日唐绍仪因王芝祥直隶都督任命事，愤袁世凯专权，辞国务总理职，出走天津。
6月29日袁世凯任命陆徵祥为国务总理。
袁世凯准工商总长陈其美辞职。
本月英商控制的开平煤矿和滦州煤矿联合成立开滦矿务总局。该局初设时，资本额200万英镑。
陆军军官学堂（1906年创办）易名为保定陆军军官学校。
台湾嘉义农民黄朝等闻辛亥革命胜利，号召乡民驱逐日寇被杀害。是谓“土库事件”。
吴玉章在四川发起四川留法俭学会。
7月1日中国同盟会本部通电宣布政见，绝对主张政党内阁。
7月9日由蔡元培倡议，历史博物馆在北京国子监旧址筹办。后迁往故宫午门，对外开放，成为第一个国立公共博物馆。
7月10日全国临时教育会议召开。会议规定学制如下：小学四年，高小三年，中学四年，大学预科三年、本科三年或四年。
7月12日袁世凯任命黎元洪、谭延闿等十省都督。
7月14日袁世凯准同盟会阁员蔡元培、宋教仁等辞总长职。
