潘汉年撤到淮南根据地以后，在新四军中并没有职务。有关饶、陈之间的历史分歧以及新四军干部中分为拥陈、拥饶两派的由来，他全都不清楚。按说，“军队内部的这场人事纠葛和他并无直接关系。他是可以‘事不关己，高高挂起’，置身于事外而宁可犯一点‘自由主义’的。然而这位思想敏捷而在政治上又决不愿意随波逐流的共产党人，偏偏看不惯饶漱石的这一套整人谋术，而对于堂堂正正、光明磊落的陈毅，却很理解和同情”。因此，“当饶漱石利用整风的机会，搞小动作打击和排挤陈毅时，潘汉年很为陈毅不平，并且表示了对饶的不满意见，还将他的意见和另一些干部交谈过。”他为了表达对饶漱石的不满，同时也为了表示对陈毅同志的才气与人品的敬重，曾公开写了一首七言绝句赠陈毅：
拓略经给晋谢风，
雄师十万过江东。
皮岭三军惊绒胆，
王桥一战定华中。
事后追论，潘汉年如此而为不乏书生气，但也却真实地反映了潘汉年可爱的性格中的另一面，使他后来为这所谓的“黄花塘事件”付出了很大的代价！
随着全党性的整风运动的发展，在延安开展的所谓“抢救失足者运动”，也波及到了淮南根据地。建国以后被打成“潘杨反革命集团”的杨帆同志，突然被逮捕审查，在新四军的干部中造成了很大的影响，而且潘汉年一跃成为审查杨帆一案的三人领导
